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系统与合成生物学

BMEN90027

Systems and Synthetic Biology

学习目标

课程内容:

本课程将介绍生物系统的数学和计算建模、模拟和分析。重点是利用MATLAB开发模型,并结合实例进行教学。

课程主题:

模拟生化反应。质量作用定律。酶和酶反应的调节。可逆生化反应热力学。细胞稳态。常微分方程在这些问题中的应用。

模拟大型反应网络。通量平衡分析和基于约束的方法。基因组规模的模型。基因表达的调节。系统和合成生物学中的基因调控网络。经济数据的网络推理和统计建模。系统生物学中基于知识的建模。

学习成果:

顺利完成本课程后,学生应该能够:

1、评估生物系统的数学和计算模型的作用;

2、运用质量作用定律发展生化反应的常微分方程模型;

3、开发和分析细胞生物工程和合成生物学中酶催化反应的模型;

4、演示常微分方程和偏微分方程模型在分子和细胞生理学中的应用;

5、描述系统和合成生物学的前提;

6、开发和分析生物系统和合成生物学的大规模网络模型;

7、解释基于知识的建模在系统生物学中的作用;

8、评估和使用系统和合成生物学的测量技术和数据来源。

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